MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 40374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021738	AAT	2	6	336809	336814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655993
5502	NC_021738	T	7	7	336835	336841	0 %	100 %	0 %	0 %	525655993
5503	NC_021738	CAA	2	6	336849	336854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655993
5504	NC_021738	ATG	2	6	337221	337226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655994
5505	NC_021738	AAG	2	6	337255	337260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655994
5506	NC_021738	TGA	2	6	337289	337294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655994
5507	NC_021738	A	7	7	337294	337300	100 %	0 %	0 %	0 %	525655994
5508	NC_021738	ATTAA	2	10	337302	337311	60 %	40 %	0 %	0 %	525655994
5509	NC_021738	GCC	2	6	337320	337325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655994
5510	NC_021738	CAAG	2	8	337346	337353	50 %	0 %	25 %	25 %	525655994
5511	NC_021738	GATGC	2	10	337395	337404	20 %	20 %	40 %	20 %	525655994
5512	NC_021738	GAA	2	6	337413	337418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655994
5513	NC_021738	GTAA	2	8	337494	337501	50 %	25 %	25 %	0 %	525655994
5514	NC_021738	TCT	2	6	337522	337527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655994
5515	NC_021738	TGA	2	6	337768	337773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655994
5516	NC_021738	TCA	2	6	337853	337858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655995
5517	NC_021738	CAAT	2	8	337874	337881	50 %	25 %	0 %	25 %	525655995
5518	NC_021738	T	6	6	337925	337930	0 %	100 %	0 %	0 %	525655995
5519	NC_021738	TAA	2	6	338119	338124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655995
5520	NC_021738	CGC	2	6	338159	338164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655995
5521	NC_021738	AT	3	6	338177	338182	50 %	50 %	0 %	0 %	525655995
5522	NC_021738	AGC	2	6	338190	338195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655995
5523	NC_021738	CAT	2	6	338232	338237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655995
5524	NC_021738	GTT	2	6	338283	338288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655995
5525	NC_021738	CGC	2	6	338355	338360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655996
5526	NC_021738	ATTG	2	8	338363	338370	25 %	50 %	25 %	0 %	525655996
5527	NC_021738	ACC	2	6	338390	338395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655996
5528	NC_021738	CCT	2	6	338418	338423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655996
5529	NC_021738	AAT	2	6	338494	338499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655996
5530	NC_021738	ACT	2	6	338546	338551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655996
5531	NC_021738	TAA	2	6	338613	338618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655996
5532	NC_021738	TC	3	6	338627	338632	0 %	50 %	0 %	50 %	525655997
5533	NC_021738	T	6	6	338685	338690	0 %	100 %	0 %	0 %	525655997
5534	NC_021738	TTC	2	6	338775	338780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655997
5535	NC_021738	CAC	2	6	338975	338980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655997
5536	NC_021738	ATC	2	6	339006	339011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655997
5537	NC_021738	AGC	2	6	339039	339044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655997
5538	NC_021738	CAA	2	6	339071	339076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655997
5539	NC_021738	TTC	2	6	339090	339095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655997
5540	NC_021738	CCA	2	6	339125	339130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655997
5541	NC_021738	TTG	2	6	339188	339193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655997
5542	NC_021738	CAT	2	6	339285	339290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655998
5543	NC_021738	AAT	2	6	339474	339479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655998
5544	NC_021738	CCAG	2	8	339582	339589	25 %	0 %	25 %	50 %	525655998
5545	NC_021738	ACC	2	6	339610	339615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655998
5546	NC_021738	CCG	2	6	339660	339665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655998
5547	NC_021738	CGG	2	6	339692	339697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655998
5548	NC_021738	TTA	2	6	339827	339832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655999
5549	NC_021738	GCC	2	6	339921	339926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655999
5550	NC_021738	GCA	2	6	339975	339980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655999
5551	NC_021738	CAT	3	9	340021	340029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655999
5552	NC_021738	TGC	2	6	340119	340124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655999
5553	NC_021738	T	6	6	340204	340209	0 %	100 %	0 %	0 %	525655999
5554	NC_021738	TTG	2	6	340217	340222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655999
5555	NC_021738	CTT	2	6	340231	340236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655999
5556	NC_021738	CGT	2	6	340253	340258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655999
5557	NC_021738	CAT	2	6	340285	340290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655999
5558	NC_021738	AAT	2	6	340418	340423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
5559	NC_021738	CTC	2	6	340430	340435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655999
5560	NC_021738	TTG	2	6	340448	340453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655999
5561	NC_021738	CAG	2	6	340591	340596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655999
5562	NC_021738	AATC	2	8	340663	340670	50 %	25 %	0 %	25 %	525655999
5563	NC_021738	CTT	2	6	340720	340725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655999
5564	NC_021738	TAA	2	6	340745	340750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
5565	NC_021738	ATA	2	6	340765	340770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
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5567	NC_021738	TCT	2	6	340824	340829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655999
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5569	NC_021738	TAA	2	6	340847	340852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
5570	NC_021738	AAT	2	6	340985	340990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
5571	NC_021738	T	6	6	340992	340997	0 %	100 %	0 %	0 %	525655999
5572	NC_021738	AAT	2	6	341030	341035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655999
5573	NC_021738	GCAATC	2	12	341046	341057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525655999
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5589	NC_021738	AGTGA	2	10	341977	341986	40 %	20 %	40 %	0 %	525656000
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5593	NC_021738	ATA	2	6	342181	342186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656000
5594	NC_021738	TTG	2	6	342282	342287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656000
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5601	NC_021738	ACG	2	6	342688	342693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656001
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5604	NC_021738	TTG	2	6	342781	342786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656001
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5613	NC_021738	GTT	2	6	343178	343183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656001
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5617	NC_021738	TC	3	6	343446	343451	0 %	50 %	0 %	50 %	525656002
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5621	NC_021738	ATG	2	6	343739	343744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656002
5622	NC_021738	TAAA	2	8	343800	343807	75 %	25 %	0 %	0 %	525656002
5623	NC_021738	TGAT	2	8	343816	343823	25 %	50 %	25 %	0 %	525656002
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5634	NC_021738	CAT	2	6	344539	344544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656002
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5742	NC_021738	TTC	2	6	350444	350449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656006
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5859	NC_021738	TC	3	6	357010	357015	0 %	50 %	0 %	50 %	525656011
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5861	NC_021738	CATTT	2	10	357024	357033	20 %	60 %	0 %	20 %	525656011
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5863	NC_021738	ATC	2	6	357211	357216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656011
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5989	NC_021738	ATT	2	6	365008	365013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655629
5990	NC_021738	ATT	2	6	365032	365037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655629
5991	NC_021738	AAT	2	6	365047	365052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655629
5992	NC_021738	CCA	3	9	365108	365116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655629
5993	NC_021738	GCT	2	6	365344	365349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656016
5994	NC_021738	CTT	2	6	365385	365390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656016
5995	NC_021738	TCA	2	6	365401	365406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656016
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5997	NC_021738	TCA	3	9	365521	365529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656016
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6000	NC_021738	TGAT	2	8	365735	365742	25 %	50 %	25 %	0 %	525656017

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